В настоящее время ряд вопросов организации лесного хозяйства в республике имеет определенные проблемы и требует существенного изменения основных направлений деятельности.
Основными негативными факторами, влияющими на состояние лесных насаждений республики, являются лесные пожары и болезни. Под воздействием их происходит постоянное нарушение устойчивости лесов и, как следствие, ухудшение санитарного и лесопатологического состояния насаждений.
Наличие значительного количества населенных пунктов, расположенных вблизи границ, высокая плотность населения создают рекреационную нагрузку на леса, что повышает опасность возникновения лесных пожаров.
За 2007-2011 годы на территории лесного фонда произошел 61 лесной пожар, общая площадь лесов, пройденная лесными пожарами, составила 884 гектара.
За последние 20 лет органам лесного хозяйства республики практически не выделялись средства на приобретение специализированной лесопожарной техники и оборудования.
Созданное в республике специализированное автономное учреждение по тушению лесных пожаров и осуществлению отдельных мер пожарной безопасности в лесах не имеет помещений для размещения средств технического оснащения, лесопожарных команд.
Обеспеченность специализированного лесопожарного центра лесопожарной техникой и оборудованием крайне низкая.
Из-за отсутствия специальной лесопожарной техники и оборудования в необходимом количестве не удается вести эффективную борьбу с лесными пожарами, своевременно локализовать и ликвидировать очаги возгорания.
С целью предупреждения вспышек массового размножения и распространения вредных насекомых и болезней, способных вызвать гибель насаждений или резкое падение прироста древесины и снижение ее качества, проводится комплекс работ, включающих санитарно-оздоровительные мероприятия и лесопатологические обследования.
Санитарно-оздоровительные мероприятия в лесах проводятся в виде выборочных, сплошных санитарных рубок и уборки захламленности.
Локализация и ликвидация очагов вредных насекомых проводятся по мере необходимости.
Все пройденные рубкой участки леса необходимо своевременно восстанавливать. Заготовка древесины в лесах Республики Дагестан осуществляется при рубках, связанных с уходом за лесами, а также с расчисткой лесных площадей при использовании лесных участков.
Ежегодно лесовосстановительные работы проводятся на площади около 900 гектаров. Основным способом лесовосстановления на территории республики является искусственное.
Качество лесных культур и сохранность во многом зависят от качества семян и посадочного материала, агротехнических и лесоводственных уходов за ними в процессе создания.
На проведение лесокультурных работ ежегодно требуется около 2,1 млн. шт. стандартных сеянцев. Посадка леса часто осуществляется нестандартным посадочным материалом или материалом, выбранным из-под полога леса.
Повышение эффективности ведения лесного хозяйства требует усиления системы государственного лесного контроля и надзора, пожарного надзора в лесах.
В республике неравномерно развита сеть лесных дорог. Их общая протяженность составляет 2,6 тыс. км, т.е. на 1 тыс. га земель лесного фонда приходится 8,2 км дорог (при норме 10-12 км на 1000 га).
Федеральными органами на строительство лесных дорог в последние годы финансовые средства не выделяются.
В связи с этим, учитывая, что дороги имеют не только экономическое, но и социальное значение, расходы на их строительство планируются из республиканского бюджета Республики Дагестан.
В рамках существующей системы финансирования мероприятий по охране, защите и воспроизводству лесов невозможно создать эффективные механизмы, обеспечивающие устойчивое управление лесами, сохранение биологического разнообразия лесов, повышение их потенциала.