Организация управления программой и контроль за ходом ее реализации осуществляются Минсельхозпродом РД.
Не реже одного раза в год на заседании коллегии Минсельхозпрода РД заслушивается отчет о ходе реализации программных мероприятий.
Минсельхозпрод РД обеспечивает в установленном порядке представление необходимой информации о ходе работ программы и об эффективности использования финансовых средств.
Республика Дагестан в соответствии с заключенным с Министерством сельского хозяйства Российской Федерации соглашением о реализации мероприятий по развитию семейных животноводческих ферм на базе крестьянских (фермерских) хозяйств обязуется обеспечить соответствие значений показателей, устанавливаемых региональной программой, значениям показателя результативности предоставления субсидий, установленным указанным соглашением.