Программа предполагает деятельность предприятий и организаций различных форм собственности. Затраты на разведение и содержание животных несут непосредственно хозяйства. Затраты на искусственное осеменение несет Респлемобъединение на договорной основе с хозяйствами и из средств бюджета, определенного соответствующим постановлением Правительства РА.
Затраты на НИР и проведение селекционно - племенной работы, осуществляемые Горно-Алтайским НИИ сельского хозяйства, предусматриваются из республиканского бюджета. Финансирование НИР осуществляется согласно тематическому плану института, календарному плану мероприятий по селекционно - племенной работе и смете расходов, предоставляемых ежегодно.
Бухгалтерский учет, контроль за использованием финансовых средств и отчетность осуществляются в порядке, предусмотренном законодательством.