Земельные преобразования в республике начаты в 1991 - 1992 гг. с создания крестьянских хозяйств, реорганизации и разделения сельскохозяйственных предприятий. Общее количество сельскохозяйственных предприятий различных организационно - правовых форм в результате проведения этих работ сегодня составляет 134 против 79, имевшихся в 1990 году. Процесс реорганизации и разделения сопровождался землеустроительным обеспечением, разработкой и осуществлением проектов перераспределения земель. В результате ситуация с перераспределением земель своевременно и полностью учтена. Сельским администрациям переданы земли населенных пунктов, земли для обеспечения жителей сенокосами и пастбищами и другие угодья, которые будут входить в состав муниципальной собственности. Обеспечена реализация прав граждан на получение земельных участков для создания крестьянских хозяйств, произведена передача сельскохозяйственных земель в собственность сельскохозяйственных предприятий. Сегодня за 59 сельхозпредприятиями земельные угодья закреплены в собственность на площади 352 тыс. га, что составляет 29% площади всех сельскохозяйственных угодий, находящихся в сельскохозяйственном производстве.
По каждому району рассчитаны земельные доли в гектарах, которыми наделены работающие в сельскохозяйственном производстве и другие лица, имеющие право на получение земельных долей и распоряжение ими. Таким образом, в сельском хозяйстве устранена монополия государственной собственности на землю.
За период 1991 - 1999 гг. в республике создано 1826 крестьянских хозяйств. За этот же период закрыто 639 крестьянских хозяйств. Каждое третье крестьянское хозяйство закрыто, в основном, по причине неиспользования земель или добровольного отказа от ведения хозяйства.
Из 10 районов республики не прошли реорганизацию и не приватизировали земли сельхозпредприятия Улаганского и Кош-Агачского районов.
Из вопросов, поставленных законодательством РФ в реформенный период не нашли решения в Республике Алтай следующие:
1. Перевод лесных земель в нелесные земли для использования их в целях, не связанных с ведением лесного хозяйства, пользованием лесным фондом и изъятие земель лесного фонда в лесах 1 группы. Это вопрос особой важности по нему имеется несколько протестов прокурора РА, которые отменяют метод его решения на уровне республики.
2. Продажа земельных участков расположенным на них приватизированным предприятиям.
3. Продажа гражданам и юридическим лицам земельных участков под объектами недвижимости в сельской местности.
4. Продажа гражданам и юридическим лицам земельных участков, предназначенных для застройки и расположенных на территориях городских и сельских поселений, или права их аренды.