Сельскохозяйственным производством в районе занимается 27 сельхозпредприятий, 116 крестьянских хозяйств, из них заняты сельскохозяйственным производством 48 хозяйств. Переработкой сельхозпродукции занимаются предприятия: Усть-Коксинский мясокомбинат, маслосырозавод СПК "Амурский", ЗАО Усть-Коксинский маслосырозавод, колбасный цех Усть-Коксинского райпо, ЗАО "Терек".
В 1999 году в сравнении с 1998 годом наблюдается рост поголовья крупнорогатого скота на 1%, в том числе коров на 4%, поголовья маралов на 8%.
Увеличилась продуктивность животных: ягнят на 100 маток, что составляет 46% к прошлому году, настриг шерсти с одной головы овцы увеличился на 5%, надой на одну фуражную корову увеличился на 100 кг, или 7%.
Произошли изменения в производстве основных видов продукции. Так, производство молока в текущем году по сравнению с 1998 годом увеличилось на 3839 ц, что составляет 6%, производство консервированных пантов увеличилось с 10820 кг до 11409, или на 5%, вместе с тем снизилось производство на убой скота и птицы на 29%, шерсти на 23%.
Повысилась урожайность зерновых культур в 2 раза по сравнению с 1998 годом. Так, ЗАО "Терек" заготовило 500 тонн продовольственной пшеницы для дальнейшей переработки ее на муку, что обеспечит население района качественным хлебом, произведенным на основе местного сырья.
Производство сельскохозяйственной продукции с учетом пантовой составляет 30,6 млн. руб., или 30% от общего объема производства продукции в республике. Затраты на одну условную голову в текущем году составили 796 рублей, что на 157 рублей выше, чем в 1998 году. Тем не менее получено сельскохозяйственной продукции на одну голову на сумму 1178 рублей, что на 538 рублей выше, чем в 1998 году. Для успешного ведения отраслей растениеводства в районе необходимо увеличивать посевные площади, яровой сев зерновых и кормовых культур. Для увеличения посева зерновых и кормовых культур необходимо иметь собственные семена, их требуется 4550 тонн. Разрабатывается система семеноводства. Для производства собственных семян требуется создание семеноводческих хозяйств. Создан сортоиспытательный участок на базе ПУ-2. Цель работы сортоучастка - выявление и рекомендация наиболее пригодных сортов различных культур для возделывания в условиях Усть-Коксинского района и размножения этих сортов. Для увеличения продуктивности пашни необходимо иметь ежегодно 3000 тонн минеральных удобрений. Внесение органических удобрений не менее 200 тыс. тонн из расчета внесения 520 тонн на 1 га. Для развития собственного семеноводства требуются инвестиции. За последние три года наблюдается тенденция увеличения посевных площадей. Если в 1997 году посевные площади составили 26700 га, то в 1999 г. - 29140 га. Увеличиваются площади зерновых культур, в 1997 году зерновых было посеяно 7906 га, урожайность 5,5 ц с 1 га. В 1998 году - 8045 га, урожайность 7 ц с 1 га, в 1999 году - 9022 га, урожайность составила около 15 ц с 1 га. Увеличилось количество кормоединиц. Если в 1998 году по району заготовлено 15,3 тыс. тонн к. ед., в 1999 году 17,3 тыс. тонн к. ед. Из 27 сельхозпредприятий района 14 хозяйств закончили 1998 год с убытками 9,2 млн. руб.
Повышение цен на сельскохозяйственную продукцию существенно повлияло на финансовое положение сельхозпредприятий.
За период с 1998 - 99 года хозяйствам района причитается дотаций из федерального бюджета в сумме 1361,2 тысячи рублей, республиканского бюджета на животноводческую продукцию 2595,8 тысячи рублей, средств МЧС 2041 тысячи рублей. Выплачено дотаций из федерального бюджета 974,2 тысячи рублей, проведен зачет по дотациям из республиканского бюджета на сумму 928,8 тысячи рублей, зачет по МЧС 722,8 тысячи рублей. Кредиторская задолженность по дотациям из федерального бюджета за 1998 - 99 год 387 тысяч рублей, из республиканского бюджета 1667 тысяч рублей, МЧС 1318,2 тысячи рублей.
За последние два года хозяйствам района выделено льготных кредитов на общую сумму 3385,8 тысячи рублей, на завершение зимовки скота из ЭЭР "Алтай" - 177,8 тысячи рублей, из Фонда развития Республики Алтай - 813,6 тысячи рублей. Соответственно погашено льготных кредитов 1319 тысяч рублей, из ЭЭР "Алтай" - 177,8 тысячи рублей, из Фонда развития РА - 536,5 тысячи рублей. Задолженность хозяйств по льготным кредитам 2244,8 тысячи рублей, из фонда развития РА 277,1 тыс. руб.
За последние годы произошло резкое сокращение технического потенциала сельских товаропроизводителей района. Происходит старение машинно - тракторного парка. Увеличилось число простоев машин по причине технической неисправности, несвоевременного ремонта, обслуживания и - как результат этого наблюдается нарушение агротехники работ и снижение урожайности сельскохозяйственных культур. В районе снижение численности МТП и сельскохозяйственной техники за последние годы составило 60 - 70%. Готовность МТП составляет 50 - 60%.
Районной администрацией принимаются меры для улучшения экономического положения сельхозтоваропроизводителей. В районе создан фонд за счет использования переданной из Министерства сельского хозяйства и продовольствия РА в управление администрации Усть-Коксинского района государственной доли мараловодческих хозяйств. Разработана программа "Уймонский хлеб", которая позволит увеличить производство продовольственной пшеницы, обеспечить население района собственной мукой.
На базе КСП "Абайское" создается новая отрасль животноводства - яководство, в агрофирме "Коксинская" - свиноводство, в Усть-Коксинском райпо действует инкубатор мощностью 21 тыс. штук яиц в год.
Из перерабатывающих и обслуживающих предприятий в сезон забоя работает ОАО "Усть-Коксинский мясокомбинат", в связи со сменой собственника предприятие в 1999 году практически не работало.
Колбасный цех Усть-Коксинского РайПО за 9 месяцев 1999 года выработал колбасных изделий и копченостей 7 тонн. Кроме того РайПО занимается производством хлеба, хлебобулочных изделий, выпуском макаронных изделий, безалкогольной продукции, пива, выращиванием птицы.