1.1. Комплексное изучение природных ресурсов Республики Алтай, их рациональное использование, охрана, составление кадастра, паспортизация.
1.2. Контроль за антропогенными изменениями в природной среде на фоне естественных, составление списка основных загрязняющих веществ Республики Алтай и объектов природопользования.
1.3. Экологическая паспортизация предприятий-природопользователей.
1.4. Оценка мероприятий хозяйственной или иной деятельности и рекомендации по необходимости сохранения экологического равновесия, генофонда и разнообразия живой природы в интересах настоящего и будущего поколений с учетом социально-этнических особенностей населения Республики Алтай.
1.5. Анализ фактических результатов деятельности аккредитованной научно-исследовательской химико-экологической лаборатории и научной экспертизы с целью прогнозирования возможных нежелательных антропогенных изменений окружающей среды.
1.6. Оценка воздействия конструкций ракет типа "Протон" и токсичного топлива на природную среду Республики Алтай и сопредельные регионы.
1.7. Влияние экологических факторов на здоровье детей Республики Алтай.
1.8. Инвентаризация природных ресурсов Горного Алтая.