На 1 января 1999 г. население Горно-Алтайска по данным республиканского комитета по статистике составило 50,6 тыс. чел. С 1926 г. (первая всесоюзная перепись населения) численность увеличилась почти в 9 раз.
До начала 90-х годов численность населения стабильно росла. Рост численности во второй половине 90-х годов вызван механическим приростом. Естественный прирост был отрицательным, то есть наблюдалось превышение уровня смертности над уровнем рождаемости.