В 1999 г. в системе образования Кош-Агачского района функционировало 15 образовательных школ с общим контингентом 4414 чел., 8 детских садов с численностью детей 296 человек, 10 пришкольных интернатов, в которых проживало 190 чел., 2 учреждения дополнительного образования, в которых занимались в различных кружках 1941 чел.