Чойский район располагается в северной части Республики Алтай, занимает площадь 4526 кв. км, или 4,87% от площади Республики Алтай. Численность населения - 9,5 тысячи человек.
Район граничит на юго-западе с Чемальским районом, на юге-Онгудайским районом, на востоке - Турочакским районом. Большинство населенных пунктов района находятся в стороне от основной дороги, это влияет на ряд социально-экономических факторов района:
- сдерживание развития культуры и образования;
- сдерживание развития туризма;
- снижение подвижности населения, развития малого бизнеса;
- высокая себестоимость продукции из-за транспортных расходов;
- недостаточное развитие производственной инфраструктуры, прежде всего связи и транспорта, тепло- и электроэнергетики.
С другой стороны, отдаленность и труднодоступность района имели положительные последствия в виде сохранности природы в первозданном виде, нетронутыми остались многие памятники природы, культуры, истории. Была сохранена флора и фауна района.
Район занимает выгодное геостратегическое положение, поскольку граничит со многими районами республики.