Программа рассчитана на 5 лет и ее планируется реализовать в два этапа.
На первом этапе (2002 - 2003 годы) предусматривается определить пути и меры для преодоления неблагоприятной тенденции роста в Республике Алтай, количество и масштабы последствий чрезвычайных ситуаций. Особое внимание будет уделено разработке более эффективных мероприятий, обеспечивающих получение результатов в ближайшей перспективе. Предусматривается разработка научных нормативно - методических, организационных и экономических основ для дальнейшей практической реализации программных мероприятий в полном объеме.
На втором этапе (2004 - 2005 годы) планируется обеспечить практическую реализацию основных положений Программы. Предусматривается возможность корректировки мероприятий, осуществляемых на этом этапе реализации Программы, на основе анализа полученных на первом этапе результатов и с учетом выделенных объемов финансирования.