После принятия и утверждения Программы государственный заказчик Фонд развития и поддержки малого предпринимательства РА обеспечивается финансовыми ресурсами, определенными Законом РА "О бюджете Республики Алтай", на основе бюджетной заявки.
Выделение Фонду бюджетных средств производится в соответствии с утвержденным Правительством Республики Алтай реестром - раздел "Поддержка малого предпринимательства" по согласованному графику между Фондом и Министерством финансов Республики Алтай.
Договоры и контракты на выполнение работ, предусмотренных программными мероприятиями, заключаются на конкурсной основе.
Механизм реализации Программы сочетает методы государственного регулирования и рыночную самонастройку.