Мероприятия Программы реализуются за счет средств бюджета Республики Алтай, а также за счет средств потенциальных участников свободной таможенной зоны "Горный Алтай".
На 2003 г. необходимая сумма финансовых ресурсов составляет 500,0 тыс. рублей.
Объем финансирования мероприятий Программы за счет средств республиканского бюджета ежегодно подлежит уточнению в установленном порядке при формировании проекта республиканского бюджета на соответствующий год.