Система управления Программой направлена на достижение поставленных Программой целей и задач и эффективности от проведения каждого мероприятия, а также получение долгосрочных устойчивых результатов.
Общее руководство, контроль и мониторинг за ходом реализации Программы осуществляет заместитель министра - начальник управления по отраслевому развитию Министерства.
Ответственными исполнителями мероприятий Программы являются отдел осуществления государственных полномочий в области животноводства и племенного дела, отдел воспроизводства и использования объектов животного мира и водных биологических ресурсов Министерства, отделы Министерства по направлениям своей деятельности.
Отдел осуществления государственных полномочий в области животноводства и племенного дела Министерства осуществляет:
- координацию деятельности по реализации мероприятий Программы;
- подготовку и представление в Минсельхоз России документации для участия в конкурсном отборе региональных программ субъектов Российской Федерации.
Отдел осуществления государственных полномочий в области животноводства и племенного дела Министерства и отдел воспроизводства и использования объектов животного мира и водных биологических ресурсов Министерства осуществляют:
- рассмотрение материалов о ходе реализации Программы и по мере необходимости уточнение мероприятий, предусмотренных Программой, объемов финансирования;
- организацию размещения в электронном виде информации о ходе и результатах реализации Программы;
- несут ответственность за своевременную и полную реализацию программных мероприятий.
Отдел осуществления государственных полномочий в области животноводства и племенного дела Министерства:
- представляет в министерство экономического развития Калужской области информацию о Программе с учетом редактирования Программы для размещения на интернет-сервере органов власти Калужской области.
Отдел бюджетного финансирования Министерства осуществляет:
- подготовку отчета об использовании бюджетных средств в рамках реализации мероприятий Программы.
Отдел организационно-контрольной и юридической работы осуществляет:
- организацию юридической экспертизы проектов нормативных правовых актов по реализации Программы;
- взаимодействие со средствами массовой информации по вопросам освещения хода реализации мероприятий Программы.
Исполнители мероприятий Программы несут ответственность за своевременную и полную реализацию программных мероприятий и за достижение утвержденных значений целевых индикаторов Программы.
Порядок и условия предоставления субсидий областного бюджета, предоставляемых на мероприятия Программы, определяются действующим законодательством.
Порядок и условия взаимодействия по реализации Программы с федеральным бюджетом, кредитными и другими организациями, участниками Программы определяются действующим законодательством и соглашениями с Министерством сельского хозяйства Российской Федерации и при необходимости с кредитными и другими организациями.
Отдел осуществления государственных полномочий в области животноводства и племенного дела Министерства является ответственным исполнителем за подготовку информации о ходе реализации Программы и ее представление ежегодно до 1 марта в министерство экономического развития Калужской области и министерство финансов Калужской области.