Комиссия формируется и действует на основе принципов:
- законности;
- добровольности участия сторон в деятельности Комиссии;
- паритетности соблюдение принципа равного представительства сторон Комиссии;
- равноправия сторон Комиссии и доверие в отношениях;
- полномочности сторон Комиссии;
- взаимной ответственности сторон Комиссии;
- самостоятельности и независимости каждого окружного объединения профессиональных союзов, каждого окружного объединения работодателей, Администрации автономного округа при определении персонального состава своих представителей в Комиссии.