Ликвидация Счетной палаты Таймырского (Долгано-Ненецкого) автономного округа осуществляется Администрацией Таймырского (Долгано-Ненецкого) автономного округа в соответствии с Федеральным законодательством. Состав ликвидационной комиссии определяется Администрацией Таймырского (Долгано-Ненецкого) автономного округа.