Организацию управления подпрограммой 4 осуществляет Агентство.
Функции Агентства по управлению подпрограммой 4:
конкурсный отбор исполнителей мероприятий подпрограммы 4;
текущий контроль за ходом реализации мероприятий подпрограммы 4;
подготовка отчетов о реализации подпрограммы 4.
Агентство для обеспечения мониторинга и анализа хода реализации подпрограммы 4 организует ведение и представление ежеквартальной отчетности (за первый, второй и третий кварталы).
Отчет о реализации подпрограммы 4 представляется Агентством одновременно в министерство экономического развития и инвестиционной политики Красноярского края и министерство финансов Красноярского края за первое полугодие отчетного года в срок не позднее 10-го августа отчетного года.
Годовой отчет о ходе реализации подпрограммы 4 формируется Агентством до 1 марта года, следующего за отчетным и представляется одновременно в министерство экономического развития и инвестиционной политики Красноярского края и министерство финансов Красноярского края.
Финансовый контроль за соблюдением условий, целей и порядка предоставления средств краевого бюджета их получателям осуществляется Агентством, службой финансово-экономического контроля и контроля в сфере закупок Красноярского края, внешний государственный финансовый контроль за использованием средств краевого бюджета осуществляется Счетной палатой Красноярского края в соответствии с действующим законодательством.