Общими направлениями развития государственной системы здравоохранения являются:
разграничение компетенции между органами управления здравоохранением различных уровней (республиканскими и муниципальными), повышение самостоятельности лечебно - профилактических учреждений в выборе стратегии развития, целей, содержания и методов работы, создание правовых и экономических гарантий их автономности;
достаточное бюджетное финансирование в соответствии с социально гарантированными и научно обоснованными нормативами;
привлечение внебюджетных средств (средства Территориального фонда обязательного медицинского страхования, различных межведомственных фондов, поступления от платных медицинских услуг, целевое финансирование приоритетных программ по охране здоровья);
устойчивое кадровое обеспечение отдаленных населенных пунктов и сельских улусов путем организации индивидуальной подготовки кадров в медицинских учебных заведениях, укомплектование врачебных участков врачами общей практики (семейными врачами), целевая подготовка квалифицированных специалистов по обслуживанию современной медицинской техники;
разработка северных нормативов (стандартов) кадрового, материально-технического обеспечения на этапах медико-санитарной помощи;
структурная перестройка системы здравоохранения в соответствии со стратегией экономической реформы на основе проведения лицензирования и аккредитации всех лечебно-профилактических учреждений;
установление республиканских требований (государственных медико-технологических стандартов) к содержанию, уровню и качеству оказания медицинской помощи;
повышение диагностических возможностей первичного звена здравоохранения (ФП, ФАП, участковые больницы и амбулатории) на основе внедрения систем дистанционной диагностики, компьютерного банка данных о здоровье населения, обеспечения современной медицинской техникой и подготовки квалифицированных кадров;
дальнейшее развитие санитарной авиации, широкое использование современного передвижного, переносного лечебно-диагностического оборудования и аппаратуры;
материально-техническое, кадровое, финансовое обеспечение центральных улусных, городских, поселковых больниц для оказания лечебно-диагностической специализированной помощи II этапа по основным клиническим специальностям (терапия, хирургия, акушерство-гинекология, педиатрия);
дальнейшее развитие специализированной медицинской помощи на базах Национального центра медицины;
максимальное приближение специализированной помощи сельскому населению путем открытия многопрофильных больниц с диспансерными отделениями на базах крупных центральных улусных больниц;
создание собственного производства изделий медицинского назначения и лекарственных препаратов с использованием местных сырьевых ресурсов;
эффективное использование капвложений на строительство объектов здравоохранения и жилья;
строительство модульных вариантов объектов здравоохранения в улусах;
участие в реализации программы государственной политики по сохранению генофонда народов Якутии;
утверждение и поддержка приоритета здорового образа жизни граждан, профилактика, лечение, реабилитация больных, страдающих алкоголизмом, наркоманией, токсикоманией, с применением новейших, высокоэффективных методов и технологий;
совершенствование форм работы с населением по внедрению принципов, ориентирующих на сохранение и укрепление физического и духовного здоровья в условиях рыночной экономики и политической нестабильности.