3.1. Структура Института разрабатывается и совершенствуется, исходя из основных направлений исследований и текущих задач Института, директором и утверждается Ученым советом Института. Структурными подразделениями являются отделы, лаборатории, группы клинические отделения.
3.2. Структурные подразделения Института действуют в соответствии с положениями о них, утвержденными директором Института.
3.3. Для реализации новых направлений исследований и целевых комплексных программ Институт вносит предложения в Академию наук Республики Саха (Якутия) о создании межведомственных научных коллективов, создаваемых совместно с другими министерствами и ведомствами.
В Институте могут в порядке научной кооперации и в соответствии с законодательством создаваться совместно с другими научно-исследовательскими учреждениями, высшими учебными заведениями и производственными предприятиями (объединениями) временные научные и научно-технические коллективы (комплексы), предназначенные для решения конкретных научных и научно-производственных задач. Деятельность временных научных и научно-технических коллективов (комплексов) осуществляется на базе Института или на базе организации-заказчика на договорной основе в соответствии с действующим законодательством.
3.4. Институт имеет право выступать учредителем, по согласованию с Президиумом Академии наук Республики Саха (Якутия) и в соответствии с действующим законодательством, совместных и других предприятий, являться членом ассоциаций, различных творческих объединений и других организаций.