Сохранение и развитие системы ООПТ Республики Саха (Якутия) в связи с ее глобальной значимостью в поддержании экологического равновесия и сохранении биоразнообразия в условиях криолитозоны, определяющей состояние климата всего континента, а также планами комплексного развития производительных сил, транспорта и энергетики Республики Саха (Якутия) до 2020 года, является одним из декларированных приоритетов государственной экологической политики республики.
Опыт создания и внедрения в условиях рыночной экономики уникальной республиканской системы ООПТ "Ытык Кэрэ Сирдэр" положительно оценен российской общественностью и мировым сообществом. Ведется работа по включению природного парка "Ленские столбы" в Список мирового культурного и природного наследия ЮНЕСКО. Ресурсный резерват республиканского значения "Кыталык" включен в Международную сеть особо охраняемых местообитаний редких журавлей Северо-Востока Азии (1997 г.). В число модельных российских территорий крупнейших международных проектов Программы ООН по охране окружающей среды и Глобального экологического фонда (UNEP/GEF) вошли ресурсный резерват "Кыталык" и Средний Алдан с ресурсными резерватами "Кюпский", "Чабда" и "Куолума-Чаппанда" (проект "Совершенствование сети охраняемых водно-болотных угодий, имеющих ключевое значение для стерха и других мигрирующих околоводных птиц в Азии", 2004 - 2009 г.г.), Нижнеколымский улус с ресурсным резерватом "Чайгургино" ("Комплексный экосистемный подход для сохранения биоразнообразия и снижения нарушенности среды обитания на трех модельных территориях Российской Арктики, 2005 - 2010 г.г.").
В настоящее время под особую охрану взято более 1/4 части территории республики, что составляет 908,0 тыс. кв. км, или около 30% площади республики, представленной уникальными или типичными арктическими и субарктическими экосистемами с их ценнейшим биологическим разнообразием. Это резервные территории - неповторимые и живописные места, эталонные ландшафты, места массового размножения, миграции и переходов диких животных, в т.ч. концентрации редких и исчезающих видов, хода и нерестилища ценных видов рыб, скопления и перелета птиц. Это исторически сложившиеся места проживания коренных малочисленных народов Севера, исполнения традиционных ритуалов поклонения природе и проведения национальных праздников, места, считающиеся священными, великими и неприкосновенными.
В состав действующей системы ООПТ входят:
1. Особо охраняемые природные территории федерального значения (3): государственные природные заповедники ("Усть-Ленский", "Олекминский") - 2, Ботанический сад Института биологических проблем криолитозоны СО РАН - 1.
2. Особо охраняемые природные территории республиканского значения (125): Природные парки ("Ленские Столбы", "Синяя", "Усть-Вилюйский", "Момский", "Колыма" и "Живые алмазы Якутии") - 6, государственный природный заказник ("Янские мамонты") - 1, ресурсные резерваты - 74, уникальные озера - 26, охраняемые ландшафты - 1 и памятники природы - 17.
3. Особо охраняемые природные территории местного (муниципального) значения - около 100 (см. табл. 1).
Также, с 1995 года на территории Якутии работает Международная научно-исследовательская станция "Лена-Норденшельд". Она образована в соответствии с Меморандумом о взаимопонимании между Республикой Саха (Якутия) и Всемирным фондом дикой природы WWF (Стокгольм, ноябрь 1993 г.) и распоряжением Президента Республики Саха (Якутия) от 14 апреля 1994 года N 195-РП для обеспечения и проведения научных и прикладных исследований в области изучения и охраны окружающей среды Арктики. Расположена в Булунском улусе Республики Саха (Якутия) на территории государственного природного заповедника "Усть-Ленский" и относится к разряду труднодоступных вследствие удаленности от населенных пунктов и расположения в суровых физико-географических и климатических условиях Арктики. Станция согласно Положению, утвержденному постановлением Правительства Республики Саха (Якутия) от 9 апреля 1996 года N 144, является научно-исследовательским и производственным структурным подразделением Министерства охраны природы Республики Саха (Якутия).