Агентство реорганизуется и ликвидируется в соответствии с законодательством Российской Федерации.
Агентство в случае реорганизации обеспечивает передачу архивных документов правопреемнику, а в случае ликвидации - государственному казенному учреждению Ярославской области "Государственный архив Ярославской области".