Основные проблемы с источниками водоснабжения п. Чернянка связаны с загрязнением мело-мергельного и альб-сеноманского водоносных горизонтов - единственных источников питьевой воды в районе. Загрязнение имеет техногенные причины и связано с воздействием не обустроенной канализацией жилой застройки, утечек из сетей производственных канализаций перерабатывающих предприятий, влиянием полей фильтрации и полей орошения стоками. Непринятие мер по предотвращению загрязнения подземных вод на протяжении длительного времени привело к вынужденному переносу водозабора на новый участок за пределы города в с. Морквино.