Настоящую Концепцию предполагается реализовать в два этапа.
В рамках первого этапа (2012 - 2013 годы) обеспечивается разработка проектов бассейнового природопользования по каждому из участков речных бассейнов области в границах муниципальных образований.
В рамках второго этапа (2012 - 2020 годы) обеспечивается выполнение мероприятий и достижение целевых показателей окружающей среды согласно разработанным проектам бассейнового природопользования.