Основными задачами Комиссии являются:
организация эффективной работы по достижению координированного межведомственного взаимодействия, обеспечению комплексного подхода к решению вопросов, связанных с противодействием распространению ВИЧ-инфекции в Чувашской Республике;
методическая поддержка организаций, осуществляющих деятельность по профилактике и борьбе с ВИЧ-инфекцией в Чувашской Республике;
обеспечение согласованных действий и оптимизация сотрудничества органов исполнительной власти Чувашской Республики, территориальных органов федеральных органов исполнительной власти, органов местного самоуправления в Чувашской Республике, общественных и иных организаций, осуществляющих деятельность по профилактике и борьбе с ВИЧ-инфекцией в Чувашской Республике;
осуществление консультативной поддержки проектов и программ по вопросам профилактики и борьбы с ВИЧ-инфекцией в Чувашской Республике, реализуемых органами исполнительной власти Чувашской Республики, территориальными органами федеральных органов исполнительной власти, органами местного самоуправления в Чувашской Республике, общественными и иными организациями, осуществляющими деятельность по профилактике и борьбе с ВИЧ-инфекцией в Чувашской Республике;
участие в разработке проектов нормативных правовых актов Чувашской Республики по вопросам профилактики и борьбы с ВИЧ-инфекцией в Чувашской Республике.