Включает в свой состав городской округ Северобайкальск, Северо-Байкальский и Муйский муниципальные районы. Северная экономическая зона имеет преимущественно транспортную специализацию территории (обслуживание Бурятского участка БАМ) с развивающимися промышленными и туристско-рекреационными функциями.