Территория находится в северо-западной части Кирилловской гряды. Котловина, в которой расположено озеро Дружинное, окружена холмами. Леса, покрывающие эту территорию, перемежаются с сельскохозяйственными угодьями, образуя мозаичный ландшафт.
Озеро окружено обширной низменной поймой, достигающей наибольшей ширины в северной и юго-западной части. Окружающая озеро слабо всхолмленная равнина частью заболочена, с небольшой степенью хозяйственного освоения. Акватория озера почти сплошь покрыта тростником и камышом озерным, между куртинами которых располагаются заросли рдестов.
Памятник природы "Дружинские ямы" расположен на северном побережье озера Дружинное и является самым активным карстом - вода через воронки уходит под землю, вплоть до полного осушения "ям". Сток озера сдерживается плотиной, построенной в 1947 - 1948 годах вместе с ГЭС. В настоящее время плотина требует капитального ремонта и полного восстановления и как гидротехнический, и как культурно-исторический объект.
Охраняемая территория является ключевой орнитологической территорией международного значения (Druzhinnoye lake and outskirts BO-004/RU233). Здесь встречаются орлан-белохвост, скопа, занесенные в Красную книгу Российской Федерации, а также лебедь-кликун - редкий охраняемый вид. Вдоль притоков рек Деминка и Черная отмечены места обитания бобров.
В состав фауны входят лось, бурундук, глухарь, рябчик, мохноногий сыч, клест-еловик, снегирь, кукушка, бурый медведь, живородящая ящерица, обыкновенная гадюка, белка, лиса, горностай, ласка, лесная куница, норка, иволга, зяблик, черный дрозд, ящерица-веретеница, заяц-беляк, белая сова, мохнатый канюк.