5.1. Департамент возглавляет начальник, назначаемый из резерва кадров или на конкурсной основе Губернатором области по представлению первого заместителя Губернатора области, курирующего вопросы народнохозяйственного комплекса, и освобождаемый от должности Губернатором области. Подчиняется непосредственно первому заместителю Губернатора области, курирующему вопросы народнохозяйственного комплекса.
5.2. Начальник департамента:
5.2.1. Руководит деятельностью департамента, несет персональную ответственность за выполнение стоящих перед ним задач.
5.2.2. Участвует в пределах компетенции департамента в разработке инструкций и методических рекомендаций.
5.2.3. Утверждает должностные инструкции для работников департамента.
5.2.4. Вносит предложения о назначении в установленном порядке на должность работников департамента.
5.3. Структура и штатное расписание утверждаются постановлением Правительства области.