Основной риск связан со сложностью определения оптимизированного набора объективных критериев и индикаторов оценки деятельности субъектов бюджетного планирования. Это в первую очередь касается органов исполнительной государственной власти, не перешедших на индикативные методы управления и стимулирования деятельности, в силу чего возможно возникновение жесткого сопротивления бюрократии проводимым преобразованиям, преодолеть которое можно только при использовании административного ресурса.