Из 37 организаций края, выполняющих научно-исследовательские разработки, 9 находится в г. Бийске, 1 - в Зональном районе. В них занято около 50% всех научных кадров края. На долю исследователей и техников приходится 61% численности персонала учреждений, 82% из которых занимаются исследованиями в области технических и естественных наук, формируя две трети научно-исследовательского корпуса естественных и технических наук Алтайского края.
С 2011 по 2014 годы затраты на научные исследования и разработки увеличились в 2,3 раза и составили 1215,7 млн рублей в г. Бийске. В Зональном районе они сократились в 2 раза до 4,9 млн рублей. Около 90% затрат на такие исследования являются внутренними (текущими). Затраты на оплату труда составляют половину из них. Практически все финансирование осуществляется в сфере естественных и технических наук. За три года выросла доля затрат на научные разработки (с 47% до 82%) и сократилась - на фундаментальные и прикладные исследования (соответственно с 14% до 7% и с 38% до 11%). Доля финансирования со стороны корпоративного сектора в 2014 году в г. Бийске составила 34%, в Зональном районе все исследования осуществляются за счет бюджетных средств.
Несмотря на рост расходов на научные исследования, общая стоимость выполненных работ уменьшилась с 1381 млн рублей до 1374 млн рублей, а доля работ, выполненных собственными силами, - с 93% до 91%. С 2011 по 2013 годы среднегодовая стоимость основных средств выросла с 2,6 млрд рублей до 3,0 млрд рублей, при этом стоимость машин и оборудования снизилась с 1,5 млрд рублей до 1,3 млрд рублей.
Основные организации ЮВЗ, занятые НИОКР: ФГУП "Бийская опытно-селекционная станция", ЗАО "Эвалар", ЗАО "Алтайвитамины", ФКП "Бийский олеумный завод", ООО "Бийский завод стеклопластиков", ЗАО "ПО Спецавтоматика", ФГБУ "Станция агрохимической службы Бийская", АО "ФНПЦ "Алтай", ФГБУН "Институт проблем химико-энергетических технологий Сибирского отделения Российской академии наук" (далее - ИПХЭТ СО РАН), БТИ АлтГТУ и др.
Объем выпускаемой в г. Бийске инновационной продукции и услуг в 2011 - 2014 годах сохранился на уровне 3,3 млрд рублей, а его доля в общем объеме отгруженной продукции сократилась с 16% до 13%. Причем, если в 2011 году 22% инновационного сектора приходилось на сферу услуг, то в 2014 году весь инновационный выпуск осуществлялся в промышленной сфере. Вклад г. Бийска в региональный выпуск инновационной продукции уменьшился с 58% в 2011 году до 33% в 2014 году за счет опережающего роста объема производства инновационной продукции в других городах и районах Алтайского края.
В 2011 - 2014 годах объем затрат на инновации организаций, находящихся на территории ЮВЗ, увеличился с 954 до 1218 млн рублей, или в 1,3 раза. Доля затрат на технологические инновации составляет 98% общего объема затрат на инновации. В структуре объема затрат на технологические инновации доля затрат на исследования сохранилась на уровне 50%, а доля затрат на приобретение оборудования увеличилась с 25% до 36%.
Более 60% объема затрат на технологические инновации предприятия г. Бийска компенсируют за счет собственных средств. Доля федерального бюджетного финансирования снизилась с 48% до 17%. В 2014 году заемные ресурсы не привлекались (в 2011 году они составляли 12% объема затрат на технологические инновации). Об увеличении инновационности экономики г. Бийска свидетельствует и то, что в 2014 году 7 организаций подали 27 патентных заявок на изобретения и 9 - на полезные модели, а в 2011 году 7 организаций подали 21 патентную заявку на изобретения и 8 - на полезные модели.
Инновационно активными крупными и средними предприятиями являются следующие: АО "ФНПЦ "Алтай", ЗАО "Эвалар", ФКП "Бийский олеумный завод", ЗАО "Алтайвитамины", ООО "Форне Кондитер", ООО "Бочкаревский пивоваренный завод", ОАО "Иткульский спиртзавод", ЗАО "ПО Спецавтоматика", АО "Бийскэнерго" и др.