Реализация программы осуществляется на основе государственных контрактов (договоров) на выполнение работ, заключаемых государственным заказчиком программы со всеми ее исполнителями. Государственный контракт определяет права и обязанности государственного заказчика и исполнителя работ, регулирует их отношения при выполнении государственного контракта, в том числе предусматривает контроль за ходом работ. В необходимых случаях государственный заказчик организует в установленном порядке конкурсный отбор исполнителей по каждому программному мероприятию.
Текущее управление реализацией программы осуществляют комитет по архитектуре и капитальному строительству администрации края и департамент по жилищно - коммунальному хозяйству и топливным ресурсам администрации края.
Комитет по архитектуре и капитальному строительству администрации края организует проведение необходимых работ по привлечению бюджетных и внебюджетных средств для реализации программы и формированию специального фонда восстановления и развития систем водоснабжения.
Для целевого финансирования программы комитет по архитектуре и капитальному строительству администрации края с учетом хода реализации программы в текущем году и проведения с исполнителями предконтрактной проработки размещения заказов по реализации программных мероприятий уточняет объемы необходимых средств для финансирования программы в будущем году и составляет соответствующие бюджетные заявки на ассигнование из федерального и краевого бюджетов с их обоснованием, а также предложения по использованию внебюджетных средств и средств местных бюджетов в комитет экономики и планирования администрации края и финансовое управление администрации края.
Комитет по архитектуре и капитальному строительству администрации края с учетом выделяемых на реализацию программы финансовых средств ежегодно уточняет целевые показатели и затраты по программным мероприятиям, механизм реализации программы, состав исполнителей.
Комитет экономики и планирования администрации края, финансовое управление администрации края, департамент по жилищно - коммунальному хозяйству и топливным ресурсам администрации края, комитет по архитектуре и капитальному строительству администрации края, комитет по природным ресурсам администрации края, комитет по водному хозяйству Приморского края и другие заинтересованные органы организуют экспертные проверки хода реализации программы. При этом обращается внимание на выполнение сроков реализации программных мероприятий, целевое и эффективное использование средств, выделяемых из бюджетов и внебюджетных источников, конечные результаты программы. По результатам экспертных проверок подготавливаются предложения для губернатора края о целесообразности продолжения работ и финансирования программы, уточнении льгот или применении санкций к участникам реализации программы.
Комитет по архитектуре и капитальному строительству администрации края ежегодно до 1 февраля направляет на имя губернатора края доклад о привлечении средств бюджетов и внебюджетных источников для реализации мероприятий программы в установленные сроки.