Сихотэ - Алинь, являясь "островной" горной лесной страной, обладает ярко выраженной спецификой биоразнообразия, обусловленной взаимопроникновением и смешением на ограниченной территории представителей различных флор и фаун, что приводит к формированию уникальных и нередко крайне сложных биотических комплексов. Их особенностью, помимо высокого биоразнообразия, является слабая степень устойчивости к прямым и опосредованным антропогенным воздействиям, обусловленная высокой подвижностью видов на границах своих ареалов и наличием в составе биоты значительного числа видов, консервативных по отношению к условиям обитания. Поддержание сложившегося биоразнообразия и процессов функционирования таких биотических комплексов обеспечивается в основном за счет создания СООПТ - основного структурообразующего звена экологического каркаса территории, в пределах которого обеспечивается стабильность экологических условий.
В то же время одна из основных проблем сохранения БР крупной горнолесной страны заключается в размещении особо охраняемых природных территорий (ООПТ) таким образом, чтобы они охватывали все наиболее важные широтные и меридиональные зоны и высотные пояса, которые на Сихотэ - Алине достаточно четко выражены. Однако часть типов высотной поясности в действующей системе ООПТ не представлена или представлена крайне недостаточно. Существующие размеры ООПТ не гарантируют также сохранение многих редких и исчезающих видов растений и животных, в том числе крупных хищников, таких как амурский тигр, белогрудый медведь и др., поскольку не учитывают зависимости видового разнообразия от площади местообитаний в соответствии с общепринятыми в теоретической экологии моделями размеров популяций. Таким образом, существующие ООПТ недостаточны по размерам и не образуют системы, представляющей все многообразие уникальных природных сообществ.