Общий контроль за исполнением Программы осуществляет Администрация города Пензы.
Контроль за выполнением мероприятий Программы и эффективным использованием выделенных для исполнения Программы средств осуществляет Управление здравоохранения города Пензы. Информация о ходе реализации мероприятий Программы представляется курирующему данный вопрос заместителю Главы администрации города Пензы ежегодно.