Система программных мероприятий включает в себя следующие приоритетные направления:
Раздел I "Нормативно-правовое обеспечение развития здравоохранения"
Раздел II "Организационно-методическое и информационное обеспечение деятельности учреждений здравоохранения г. Якутска"
Раздел III "Повышение уровня квалификации кадрового потенциала"
Раздел IV "Повышение качества и доступности медицинской помощи населению города Якутска"
Раздел V "Укрепление материально-технической базы"
Раздел VI "Информатизация системы столичного здравоохранения"
Раздел VII "Неотложные меры по борьбе с туберкулезом"
Раздел VIII "Вакцинопрофилактика"
Раздел IX "Охрана здоровья женщин и детей"
Раздел X "Онкология"
Раздел XI "Анти Вич/СПИД"
Предусматривается, в первую очередь, перераспределение лечебно-диагностической нагрузки с наиболее затратной - стационарной помощи на экономически и клинически эффективные виды помощи - амбулаторные, включая дальнейшее эффективное развитие стационарзамещающих и реабилитационных технологий. Создание действующей системы детской помощи и амбулаторной хирургии. Отработка этапности оказания медицинской помощи от фельдшерского пункта до высокотехнологичных республиканских лечебных учреждений. Повышение потенциала службы родовспоможения города Якутска, как играющую важнейшую роль в улучшении демографической ситуации.
Создание условий для реализации обеспечения гарантий населению на бесплатную медицинскую помощь, расширение доступности и повышение качества медицинского обслуживания за счет эффективного использования имеющихся ресурсов, совершенствования лечебно-диагностического процесса, профилактических и реабилитационных мероприятий, направленных на укрепление здоровья населения горожан, в том числе и путем внедрения современных информационных технологий.