Город Якутск является опорным пунктом всей транспортной системы республики. Транспорт и связь развиваются комплексно как отрасли межрайонной и межрегиональной инфраструктуры. При строительстве железной дороги до г. Якутска здесь будет сформирован крупный транспортно-логистический узел (кластер). Якутский аэропорт может обслуживать международные авиалинии, а речной порт и Ленское объединенное речное пароходство - международные перевозки грузов по реке Лена и Северному морскому пути из стран АТР в Европу. В г. Якутске размещается информационно-телекоммуникационный центр ОАО "Ростелеком", который выполняет роль региональной инфраструктурной отрасли.
Основным мероприятием данного раздела и всей Программы социально-экономического развития ГО "город Якутск" будет являться начало строительства второго пускового комплекса от ст. Правая Лена с совмещенным мостовым переходом через реку Лену в районе г. Якутска (левый берег). В рамках данного объекта будет построен мостовой переход через реку Лену длиной 3,2 км с подъездными путями в Табагинском створе. Программой предусмотрена реализация в 2013 - 2017 годах 1-ого этапа инвестиционного проекта: строительство мостового перехода для проезда автомобильного транспорта с учетом возможности организации проезда железнодорожного транспорта.
Строительство мостового перехода предполагается завершить в 2019 году и реальный эффект от строительства моста, обеспечивающего круглогодичную доступность заречной группы улусов республики, будет получен только после 2019 года. В настоящей Программе учтены объемы инвестиций в строительство мостового перехода и увеличение количества рабочих мест, которые будут заняты при строительстве моста и подъездных путей.
В Программе отражены мероприятия по модернизации авиационного транспорта со стороны Республики Саха (Якутия) и по модернизации городских пассажирских перевозок со стороны Окружной администрации г. Якутска.