Систему контроля и исполнения программы на областном и местном уровнях представляет вертикаль управления:
губернатор (глава администрации) области;
заместитель главы администрации области, курирующий работу администрации губернатора Иркутской области;
(в ред. постановления ЗС Иркутской области от 22.09.2004 N 40/16-ЗС)
руководители территориальных органов федеральных органов исполнительной власти в соответствии с их функциями;
(в ред. постановления ЗС Иркутской области от 22.09.2004 N 40/16-ЗС)
мэры (главы администраций) городов и районов выезда и вселения северных мигрантов.
Отчетность исполнения программы:
квартальная - органов местного самоуправления (администраций территорий выезда и въезда в пределах области) перед администрацией области (по согласованию);
полугодовая - администрации губернатора Иркутской области перед губернатором (главой администрации) области;
(в ред. постановления ЗС Иркутской области от 22.09.2004 N 40/16-ЗС)
годовая - администрации области перед соответствующими федеральными органами исполнительной власти, а также в составе отчета Законодательному собранию об исполнении бюджета области.