Реализация Программы предусматривает финансирование из областного бюджета и собственных средств организаций-природопользователей. Всего на реализацию Программы запланировано 3618,48 млн. руб., в т.ч.:
- областной бюджет - 197,994 млн. рублей;
- собственные средства организаций-природопользователей - 3420,486 млн. рублей.