Эффективность агломерационного развития во многом определяется размещением предприятий, территориальная близость которых упрощает взаимодействие взаимосвязанных отраслей, снижает себестоимость производства, обеспечивает синергетический эффект, а также позволяет на основе эффекта замещения стимулировать развитие собственных производственных мощностей. На основе анализа современного состояния Барнаульской агломерации определены основные направления ее развития.
Развитие агропромышленного комплекса в городе Барнауле предполагается по направлению переработки сельхозпродукции (пищевая, перерабатывающая и фармацевтическая промышленность, биотехнологии), опытно-производственной, научно-производственной и исследовательской деятельности, изготовлению средств производства для сельского хозяйства. Участие в формировании межрегионального биофармацевтического кластера, наращивание объемов производства в легкой промышленности, перевод сохранившихся промышленных предприятий на новый технологический уклад определит развитие города Барнаула как многопрофильного промышленного центра.