1) Язвенная болезнь, часто рецидивирующее течение, длительно не рубцующаяся язва, а также гигантская, каллезная или множественная язва - для морфологической оценки, консервативного лечения, отбора и подготовки на оперативное лечение.
2) Рефлюксная болезнь - для консервативного лечения и отбора на оперативное лечение.
3) Язва пищевода.
4) Хронический аутоиммунный атрофический гастрит с дефицитом веса, болевым синдромом, требующий цитоморфологической оценки и комплексного лечения.
5) Болезнь Крона (терминальный илеит).
6) Язвенный колит, впервые выявленный или часто рецидивирующий.
7) Острый неинфекционный гепатит (токсикоаллергический, аутоиммунный, лекарственный и др.) среднетяжелого и тяжелого течения.
8) Неуточненные токсические поражения печени с явлениями печеночно-клеточной недостаточности.
9) Хронический гепатит аутоиммунный.
10) Хронический гепатит неуточненный, с явлениями хронической печеночной недостаточности, требующей морфологической оценки (биопсия печени).
11) Постхолецистэктомический синдром в сочетании с хроническим панкреатитом (при отсутствии эффекта от амбулаторного лечения).
12) Синдром оперированного желудка при наличии дефицита веса, тяжелого течения демпинг-синдрома, синдрома мальабсорбции (совместно с абдоминальным хирургом).
13) Гемохроматоз.
14) Болезнь Бадда-Киари.
15) Болезнь Вильсона-Коновалова.
16) Портальная гипертензия различного генеза (совместно с ангиохирургом).
17) Нарушения обмена порфирина.
18) Нарушение обмена билирубина.
19) Анемия неясной этиологии, железо и полидефицитная анемия - для уточнения диагноза и лечения.
20) Подозрения на опухоли желудочно-кишечного тракта, гепатобиллиарной системы.
21) Острые пероральные отравления (грибами, щелочами, кислотами и др.).