Механизм реализации Программы представляет собой скоординированные по срокам и направлениям действия основных и ответственных исполнителей мероприятий Программы, отобранных на конкурсной основе Государственным комитетом Республики Мордовия по поддержке и развитию малого предпринимательства, с учетом изменяющихся социально-экономических условий. Исполнителями Программы являются заинтересованные министерства и иные органы исполнительной власти Республики Мордовия, предприятия и организации Республики Мордовия.
Управление реализацией Программы осуществляют Государственный комитет Республики Мордовия по поддержке и развитию малого предпринимательства, Министерство экономики Республики Мордовия, другие органы исполнительной власти и органы местного самоуправления Республики Мордовия, ответственные за выполнение и реализацию мероприятий Программы.
Контроль за ходом реализации Программы осуществляет отдел торговли, пищевой промышленности и развития предпринимательства Аппарата Правительства Республики Мордовия.
Контроль финансово-хозяйственной деятельности осуществляет Попечительский Совет Фонда поддержки предпринимательства и развития конкуренции Республики Мордовия.
Ежеквартально и по итогам года Фонд поддержки предпринимательства и развития конкуренции Республики Мордовия представляет коллегии Государственного комитета Республики Мордовия по поддержке и развитию малого предпринимательства отчет о целевом использовании финансовых средств, выделяемых им головным исполнителям на реализацию конкретных мероприятий Программы.
Системный подход к управлению Программой: комплексность, конкурсность, делегирование функций, взаимодействие и координация деятельности всех структур, заинтересованных в развитии предпринимательства.
Министерства и ведомства Республики Мордовия, органы местного самоуправления, являющиеся основными или ответственными исполнителями, ежеквартально, в срок до 10 числа месяца, следующего за отчетным кварталом, обязаны представлять в Государственный комитет Республики Мордовия по поддержке и развитию малого предпринимательства информацию о ходе реализации закрепленных за ними мероприятий Программы.
Государственный комитет Республики Мордовия по поддержке и развитию малого предпринимательства, ежеквартально, в срок до 20 числа месяца, следующего за отчетным кварталом, представляет в Правительство Республики Мордовия и Министерство экономики Республики Мордовия отчет о ходе реализации Программы.