Управление и контроль за ходом реализации Программы осуществляется Правительством Республики Мордовия.
Текущий контроль исполнения мероприятий Программы осуществляется Министерством экономики Республики Мордовия
Реализация Программы по отдельным направлениям программных мероприятий осуществляется на основе государственных (муниципальных) контрактов на поставки товаров, выполнение работ и оказание услуг для республиканских государственных (муниципальных) нужд, заключаемых Министерством экономики Республики Мордовия (и (или) иными исполнительными органами государственной власти Республики Мордовия, органами местного самоуправления Республики Мордовия) с исполнителями программных мероприятий в соответствии с законодательством Российской Федерации о государственных закупках. Отбор исполнителей проводится на конкурсной основе. Государственный заказчик (иной исполнительный орган государственной власти Республики Мордовия, орган местного самоуправления Республики Мордовия) осуществляет конкурсный отбор с целью более выгодного размещения заказов на поставку товаров, выполнение работ, оказание услуг для республиканских государственных (муниципальных) нужд.
Важнейшим элементом механизма реализации Программы является связь планирования, реализации, мониторинга, уточнения целевых показателей, а также корректировки мероприятий Программы и ресурсов для их реализации.