Комплексное управление Программой осуществляется субъектом бюджетного планирования - Минсельхозпродом Республики Мордовия.
Система управления реализацией Программы:
- ответственным за реализацию Программы в целом является Республиканская ветеринарная служба Республики Мордовия
- координацию деятельности учреждений и организаций, участвующих в реализации Программы, и согласование их действий по реализации программных мероприятий осуществляет отдел развития отраслей животноводства и племенного дела Минсельхозпрода Республики Мордовия;
- реализацию каждого мероприятия Программы осуществляет Республиканская ветеринарная служба Республики Мордовия;
- финансирование программных мероприятий осуществляет отдел финансов, бухгалтерского учета и отчетности Минсельхозпрода Республики Мордовия;
- мониторинг реализации программы осуществляет Республиканская ветеринарная служба Республики Мордовия и отдел развития отраслей животноводства и племенного дела Минсельхозпрода Республики Мордовия.
Реализация мероприятий Программы будет осуществляться во взаимодействии со следующими органами исполнительной власти Республики Мордовия:
- Министерство лесного, охотничьего хозяйства и природопользования Республики Мордовия;
- Министерство финансов Республики Мордовия;
- Министерство экономики Республики Мордовия;
- Министерство жилищно-коммунального хозяйства Республики Мордовия.
Программа предполагает взаимодействие с федеральными органами исполнительной власти:
- Управление Россельхознадзора по Республике Мордовия;
- Министерство внутренних дел по Республике Мордовия;
- Главное управление МЧС России по Республике Мордовия;
Порядок взаимодействия исполнительных органов власти федерации, республики, органов местного самоуправления и учреждений при возникновении и ликвидации очага АЧС на территории утверждается отдельным соглашением.