Основными задачами Службы являются:
- организация и осуществление медико - санитарного обеспечения населения при ликвидации последствий чрезвычайных ситуаций, в том числе и при террористических актах;
- создание, подготовка и обеспечение готовности органов управления, формирований и учреждений Службы к действиям в чрезвычайных ситуациях;
- обеспечение постоянной готовности и эффективной работы медицинских учреждений по оказанию экстренной медицинской помощи населению;
- участие в подготовке и обеспечении готовности органов управления и лечебно - профилактических учреждений Министерства здравоохранения Республики Татарстан к работе в чрезвычайных ситуациях;
- участие в выявлении источников чрезвычайных ситуаций, которые могут сопровождаться неблагоприятными медико - санитарными последствиями, организация постоянного медико - санитарного контроля за ними, проведение комплекса мероприятий по недопущению или уменьшению таких последствий;
- прогнозирование и оценка медико - санитарных последствий стихийных бедствий, аварий и катастроф;
- сбор и обработка информации медико - санитарного характера в области защиты населения и территорий, о медико - санитарных последствиях чрезвычайных ситуаций и ходе их ликвидации; обмен и предоставление такой информации заинтересованным министерствам, комитетам и ведомствам;
- организация взаимодействия органов управления, формирований и учреждений, участвующих в ликвидации медико - санитарных последствий чрезвычайных ситуаций, независимо от ведомственной принадлежности, координация их деятельности;
- разработка основ подготовки формирований и учреждений Службы, принципов и организации работы при ликвидации медико - санитарных последствий чрезвычайных ситуаций;
- разработка, внедрение и совершенствование методов и средств оказания экстренной медицинской помощи населению;
- разработка, внедрение и совершенствование методов и средств оказания экстренной медицинской помощи и лечения пострадавшего населения с учетом характера чрезвычайных ситуаций;
- постоянное совершенствование организационной структуры Службы и системы медико - санитарного обеспечения населения при возникновении чрезвычайных ситуаций, системы экстренной медицинской помощи населению;
- создание системы управления Службы, поддержание ее в постоянной готовности и совершенствование;
- разработка научно - методических основ подготовки и повышения квалификации специалистов Службы и организация их аттестации;
- подготовка и повышение квалификации специалистов Службы;
- разработка методических основ и участие в подготовке населения и спасателей к оказанию первой медицинской помощи при чрезвычайных ситуациях;
- создание и рациональное использование резервов медицинского имущества Службы, обеспечение экстренных поставок лекарственных средств для ликвидации последствий чрезвычайных ситуаций;
- участие в осуществлении государственной экспертизы, надзора и контроля в области защиты населения и территорий в условиях чрезвычайных ситуаций;
- участие (в сфере ответственности органов здравоохранения) в разработке и осуществлении мер по социальной защите населения, проведении гуманитарных акций, обеспечении условий для реализации гражданами своих прав и обязанностей в области защиты от чрезвычайных ситуаций;
- создание и рациональное использование резервов финансовых и материально - технических ресурсов для обеспечения деятельности Службы;
международное сотрудничество в области медицины катастроф.