Общее руководство и непосредственное управление Программой осуществляет Управление по обеспечению жизнедеятельности города (структурное подразделение исполнительно-распорядительного органа - Администрации городского округа город Уфа). Администрация городского округа город Уфа в лице Главы Администрации осуществляет руководство деятельностью Управления по обеспечению жизнедеятельности города.
Совет городского округа город Уфа (представительный орган местного самоуправления) осуществляет контроль за реализацией Программы.