Кислородный режим озера Смолино в 2006 году в течение года был хороший: содержание растворенного в воде кислорода составило по среднегодовым значениям 8,5 мг/л в северной части акватории и 9,7 мг/л - в середине озера, в створе гидропоста; насыщение воды кислородом соответствовало 73% и 78%.
По химическому составу вода в озере относится к хлоридному классу, группе натрия и калия. Минерализация озерной воды высокая - 1437 - 1560 мг/л, максимальное солесодержание в 2006 году зафиксировано в мае - 1808 мг/л.
По сравнению с прошлым годом отмечено снижение среднегодовых концентраций азота аммония в 1,4 раза, азота нитритов в 1,5 раза. Среднегодовые концентрации азотосодержащих компонентов находились на уровне ПДК, однако во время весеннего наполнения были отмечены максимальные концентрации азота аммония - 1,6 ПДК в северной части акватории озера и азота нитритов - 3,4 ПДК на середине озера.
Среднее содержание в воде органических соединений по БПК5 и нефтепродуктов находилось в рамках нормативных значений. Среднегодовая концентрация органических соединений по ХПК превышала ПДК в 2,7 раза, фторидов - в 1,5 раза.
Среди металлов отмечалось снижение среднегодовых концентраций цинка и марганца по сравнению с 2005 годом вдвое, их содержание в северной части озера соответствовало 3,2 ПДК, в середине - 4,6 и 2 ПДК соответственно, содержание меди снизилось в 1,5 раза и составило в среднем по акватории 3,4 ПДК.
В озеро Смолино сбрасываются сточные воды ЗАО "Челябинский завод металлоконструкций", а также стоки ливневой канализации:
- коллектор по ул. Гагарина (две трубы диаметром 1000 мм длиной 3 км);
- коллектор по ул. Грозненской (труба диаметром 1000 мм длиной 1 км);
- коллектор по ул. Машиностроителей (диаметром 1000 мм длиной 2,5 км).
Загрязняют озеро неорганизованные стоки частного жилого сектора (при централизованном водоснабжении в поселках отсутствует хозбытовая канализация), залповые сбросы воды с теплосетей (при их промывке). Постоянное поступление дополнительного стока приводит к подтоплению жилых районов, ухудшает санитарно-гигиеническое состояние озера.