В ходе реализации Программы планируется отслеживание процесса совершенствования организации медицинской помощи как по данным медицинской статистики (показатели здоровья прикрепленного населения), так и с использованием маркерных показателей деятельности различных служб.
Среди показателей, подлежащих мониторингу, основное место занимают такие, как динамика демографических показателей, основных ресурсов здравоохранения (численность врачей, среднего медицинского персонала, число больничных и амбулаторно-поликлинических учреждений, показатели заболеваемости).