Из внешних рисков наиболее вероятно влияние экономического риска, который заключается в вероятности изменения макроэкономической ситуации в стране в целом, параметров регионального развития (на уровне Республики Татарстан) и на территории города Казани в частности, что может повлечь изменение долгосрочных приоритетов социально-экономического развития города.
Из группы внутренних рисков наиболее вероятно возникновение методологического риска, который может возникнуть в ходе формирования порядка разработки и реализации долгосрочных муниципальных целевых программ, а также при определении оптимального набора критериев и индикаторов оценки, объективно отражающих результаты реализации долгосрочных целевых программ, а также критериев досрочного прекращения их реализации.
К внутренним рискам также относятся так называемые "риски несогласованности", которые заключаются в вероятности неадекватного согласования на долгосрочном горизонте планирования общих бюджетных параметров и параметров долгосрочных целевых программ, а также вероятности неадекватной увязки реализации работ, предусмотренных в рамках данного блока мероприятий, с выполнением работ по формированию реестра муниципальных услуг и разработке стандартов качества соответствующих муниципальных услуг, поскольку последние мероприятия выступают определенной базой, методологическим инструментарием и для формирования долгосрочных муниципальных целевых программ.