Правовую основу организации и деятельности Администрации составляют Конституция Российской Федерации, федеральные конституционные законы, федеральные законы, правовые акты Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации, федеральных органов исполнительной власти, принятые в пределах их компетенции, договоры и соглашения с федеральными органами государственной власти, Устав и законы автономного округа, правовые акты Губернатора автономного округа и иные нормативные правовые акты.