Ведение Красной книги автономного округа включает:
сбор и анализ данных об объектах животного и растительного мира, занесенных или рекомендуемых к занесению в Красную книгу автономного округа;
создание и пополнение банка данных по объектам животного и растительного мира, занесенным в Красную книгу автономного округа;
занесение в установленном порядке в Красную книгу автономного округа (или исключение из нее) объектов животного или растительного мира;
подготовку к изданию, издание и распространение Красной книги автономного округа;
подготовку предложений по специальным мерам охраны, включая организацию особо охраняемых природных территорий регионального значения и генетических банков с целью сохранения объектов животного и растительного мира, занесенных в красную книгу автономного округа;
выдачу разрешений на добывание объектов животного и растительного мира, занесенных в Красную книгу автономного округа (кроме объектов, занесенных в Красную книгу Российской Федерации).
другие мероприятия.