Ответственным исполнителем-координатором Программы является Министерство образования и науки Республики Марий Эл, соисполнителем Программы является Министерство строительства, архитектуры и жилищно-коммунального хозяйства Республики Марий Эл.
Министерство образования и науки Республики Марий Эл в ходе выполнения Программы осуществляет планирование, организацию и контроль за ходом реализации Программы.