В 2013 году изучением закономерностей воздействия изменений окружающей среды на здоровье населения автономного округа занималось ГКУ ЯНАО "Научный центр изучения Арктики" в рамках научно-исследовательских работ "Разработка модели комплексной оценки и прогноза состояния окружающей среды и здоровья населения Ямало-Ненецкого автономного округа" и "Оценка исконной среды обитания коренного малочисленного населения Ямало-Ненецкого автономного округа".
Под экологической обстановкой понимается общее состояние природной среды с точки зрения условий проживания людей и существования животных и растений. На современном уровне знаний она может быть оценена только качественно по изменению состояния атмосферного воздуха, качества почв, поверхностных и подземных вод, биологического и ландшафтного разнообразия, эффективности системы управления при обращении с отходами производства и потребления.
В настоящее время характеристика биологического и ландшафтного разнообразия выступает в качестве основы экологической политики государства, стремящегося сохранить свои биологические ресурсы, чтобы обеспечить устойчивое экономическое развитие.
Комплексную оценку естественных экологических условий наилучшим образом обеспечивает ландшафтный подход. Природная среда рассматривается как совокупность сложных территориальных комплексов (природных ландшафтов), каждый из которых характеризуется взаимосвязанным сочетанием ряда компонентов: геологического фундамента, рельефа, климата, поверхностных и подземных вод, почв, сообществ растений и животных. Очень сложно и многообразно экологическое значение для человека именно биотических компонентов ландшафта - растительности и животного мира.
Суровость климата на территории автономного округа является причиной умеренного проявления биоразнообразия на фоне других регионов. Тем не менее, в автономном округе представлено практически все разнообразие внетропических природных экосистем. Расположение территории в пределах Западно-Сибирской равнины и Полярного Урала предопределяет классически выраженную смену ландшафтных зон, подзон и районов (от арктических тундр до средней тайги с участием тундрово-гольцовых и таежно-гольцовых спектров высокой поясности).
Автономный округ играет особую роль в сохранении арктических экосистем и их видового разнообразия. Хотя в мировом биоразнообразии доля автономного округа невелика (к примеру, по позвоночным животным - это 0,7% всех видов) можно говорить в определенной мере об уникальности его флоры и фауны и, безусловно, поддержании биосферных функций на глобальном уровне, так как в пределах округа все еще сохраняются обширнейшие территории, занятые естественными экосистемами. Растительный покров региона с учетом широкой зональной и высотной дифференциации достаточно разнообразен. Во флоре автономного округа порядка 620 видов дикорастущих сосудистых растений, представленных 30 семействами и 42 родами; среди мхов отмечено 65 видов из 27 родов. Не менее 50% флористического видового разнообразия потенциально обладают различными полезными в утилитарном отношении свойствами, но в прикладном отношении изучены недостаточно. Леса в автономном округе находятся на северных пределах распространения лесных пород, по этой причине преобладают низкобонитетные низкотоварные насаждения.