Гидрографическая сеть Республики Башкортостан принадлежит трем крупным бассейнам рек I порядка - Волги, Урала и Оби и насчитывает около 13 тысяч рек протяженностью свыше 57 тыс. км и около 2000 озер. Основная часть рек по количеству и по протяженности имеет длину менее 100 км.
К бассейну р. Волги относятся левые притоки р. Камы, водосборы которых охватывают 79% территории республики. Наиболее крупные реки:
а) Белая с длиной водотока 1430 км; ее притоки - Уфа (918 км) с притоками Ай (549 км) и Юрюзань (424 км), Дема (535 км), Быстрый Танып (345 км), Сим (239 км) с притоком Инзер (307 км), Нугуш (235 км), Зилим (215 км), Сюнь (209 км);
б) Буй (228 км) с притоками Пизь (151 км);
в) Большой Ик (571 км) с притоком Усень (147 км).
К бассейну р. Урала относятся его правые притоки, занимающие 20% площади территории РБ:
г) Сакмара (798 км) с притоками Большой Ик (341 км), Зилаир - Урман (158 км), Салмыш (193 км), Зилаир - Яман (100 км);
д) Таналык (225 км).
Бассейн р. Оби не превышает 15% площади республики и представлен верховьем реки Уй (462 км) - притоком р. Тобол - р. Миасс (658 км) - притоком р. Исеть.
Густота речной сети наибольших значений достигает в увлажненных бассейнах рек Нугуш и Сим (0,51 - 0,68 км/км2), наименьшие значения - характерны для левобережных притоков р. Белой (0,27 - 0,35 км/км2), самые низкие значения (0,18 - 0,20 км/км2) отмечаются на Уфимском плато и в бассейне р. Уршак и связаны с развитием карста.
Преобладающие средние высоты речных водосборов - 200 - 500 м с максимумом до 700 - 750 м. Наибольшие высоты речных водосборов в районе Уфимского плато - от 140 до 280 м.
Водный режим рек характеризуется весенним половодьем (60 - 70% годового стока) продолжительностью 2 - 3 месяца, летней меженью (от 10 до 30% годового стока), прерываемой паводками, и зимней меженью (не превышает 10 - 15% годового стока). На горных реках половодье имеет многопиковую систему за счет прерывистого характера снеготаяния и дождевых подъемов, летние и осенние паводки нередко превышают весеннее половодье. Амплитуда колебаний максимальных весенних уровней - 2 - 6 м в бассейне р. Белой, до 8 м - в самой р. Белой, 2 - 4 м - в бассейне р. Урал.
Зимняя межень характеризуется устойчивым ледоставом продолжительностью от 145 - 150 дней. Толщина льда в марте достигает от 35 - 40 см до 85 см, мелкие реки полностью промерзают. Летная межень маловодна. Реки с малыми площадями водосбора летом пересыхают, зимой перемерзают.
Большинство рек, протекающих по территории республики, маловодны. В особенности маловодны реки юго-восточной части республики, относящиеся к бассейну р. Урал. Их среднегодовой сток, формирующийся в пределах 19% площади республики, составляет 12,5% от общего республиканского стока.